În Tokyo, recunoscut ca Shinto Teito în anul 2020, Minato Sahashi, în vârstă de 19 ani, este foarte inteligent, totuși din cauza incapacității sale de a face față sub presiune a eșuat de două ori la testul de admitere la facultate.
Minato întâlnește o fată pe nume Musubi, care într-o zi cade de fapt în ceruri. Minato află repede că este o „Sekirei” care l-a ales ca „Ashikabi”, printre grupul criptic de indivizi care posedă caracteristica moștenită care este capabilă să creeze o înțelegere - prin sărutare - cu Sekirei. Acest lucru le permite să își folosească puterea totală în conflictele de îndepărtare cu alți Sekirei și îi leagă pe Sekirei de el. Alcătuită din 108 fete adorabile, femei pline de viață și bishōnen, bătălia Sekirei într-un concurs numit „Planul Sekirei” format de Hiroto Minaka, președintele și fondatorul misterioasei și puternicului MBI Corporation.
Minato află repede că a fi soțul unei femei nu este doar distracție și jocuri, mai ales când este ales de mai mulți alți Sekirei, fiecare formând în plus un acord cu el, ca Ashikabi. Acum, Minato ar trebui să descopere o metodă pentru a supraviețui conflictelor amenințătoare de viață ale Planului Sekirei și competiției intense a însoțitorilor săi pentru el.
Sekirei sunt ființe super-puternice care folosesc un alt cod la fel ca cel al unei persoane. Nava spațială Sekirei s-a prăbușit pe Pământ în 1999 pe insula Kamikura și a fost descoperită de doi elevi, Hiroto Minaka (potențial președinte MBI) și Takami Sahashi (potențial cercetător șef MBI și mama lui Minato). La bord, perechea descoperise 108 forme de viață, explicate ca „Un stâlp și 107 păsări mici”.
