Rezumat
Povestea urmează Medaka Kurokami, un elev magnetic și atrăgător din primul an al Academiei Hakoniwa care este ales președinte al Consiliului Studențesc cu 98% din voturi. Ea abordează aceste petiții în modul ei necorespunzător și, cu tot ajutorul cu prietenul ei din copilărie Zenkichi Hitoyoshi, instituie o cutie de sugestii. Pe durata narațiunii, locurile de conducere ale consiliului studențesc sunt distribuite de ea către alți elevi, cum ar fi Mogana Kikaijima și Kouki Akune.
Consiliul studențesc află că președintele academiei înseamnă să inițieze o slujbă pentru experimentarea puternică a elevilor de rutină, Planul Flask, numit Normali, astfel încât să îi puteți transforma în anormali, adică oameni cu puteri supraomenești. Consiliul studențesc intră în conflict cu alți elevi implicați în utilizarea postului și se infiltrează în laboratorul secret al școlii.
Curând după aceea, Misogi Kumagawa, care dorește să înlocuiască Consiliul Studențesc cu unul din Medaka, provoacă un campionat Consiliul Studențesc. Din puterile sale, doi elevi sunt desigilați după înfrângerea lui Kumagawa și își finalizează transportul către Academia Hakoniwa. Cei doi tind să fie mai puternici decât anormalii și sunt numiți „Nu sunt egali”. Liderul lor, Anshin'in, amenință să repornească Planul Flask odată cu absolvenții Medaka, conducându-i pe succesori să fie instruiți de Consiliul Studențesc. Cu toate acestea, strategia exactă a lui Anshin'in ar fi aceea de a deține calitatea de președinte al Consiliului Studențesc al Zenkichi uzurpa Medaka. Zenkichi reușește și face acest lucru cu pretenția de a îmbunătăți viața de student. El îl convinge pe Medaka să permită Planul Flask pentru acei oameni care nu sunt dispuși.
Luată din responsabilitățile sale de președinte al Consiliului Studențesc, Medaka se implică în scurt timp într-un campionat pentru a-și determina soțul. Medaka devine câștigătorul, alegând să se căsătorească cu Zenkichi după ce amândoi absolvesc și intră singură. La scurt timp, prietenul apropiat Hansode Shiranui din Zenkichi părăsește școala. Zenkichi și Medaka descoperă că va ajunge să fie o altă gazdă pentru Iihiko Shishime, o ființă de 5000 de ani. El este învins de medaka și dispare după ce a renunțat la Lună pentru a nu se prăbuși spre Pământ, pur și simplu pentru a reapărea la timp pentru serviciul de sfârșit de an. După întoarcerea ei, asumă poziția tatălui ei în fața conglomeratului companiei familiei sale, grupul Kurokami, pentru a reveni ulterior, pe măsură ce noua președintă și Medaka hotărăsc să părăsească academia. La zece ani după aceea, Zenkichi își croise drum până la grupul Kurokami, devenind un muncitor de nivel înalt înainte de a se reuni cu ea, jurând amândoi să nu se mai despartă niciodată.